После каждого применения небулайзер нужно отсоединить от компрессора и разобрать. Остатки лекарства удалить. Все части, которые были в контакте с пациентом или лекарственным препаратом промывать чистой горячей водой. Дезинфекцию проводят в домашних условиях 2 раза в неделю с помощью кипячения, в условиях стационара - в соответствии с гигиеническими требованиями. Перед применением все части небулайзера должны быть сухими. Для этого их следует протереть после мытья мягкой салфеткой, не оставляющей волокон. Частое промывание небулайзера необходимо для предотвращения кристаллизации препаратов и бактериального загрязнения.
Компрессор обрабатывается протиранием чистой тканью и мягкими моющими средствами.
Категорически запрещается прочищать отверстия небулайзера иглами, проволокой – изменение диаметра ведет к потере необходимой дисперсности и, соответственно, снижению эффективности ингаляций.